我试图利用新的AVX2收集指令来加速稀疏矩阵向量乘法。矩阵采用CSR(或Yale)格式,具有指向列索引数组的行指针,列索引数组反过来保存列。这样的mat-vec mul的C代码如下所示:
for (int row = 0; row < n_rows - 1; row++) {
double rowsum = 0;
for (int col = row_ptr[row]; col < row_ptr[row + 1]; col++) {
rowsum += values[col] * x[col_indices[col]];
}
result[row] = rowsum;
}
现在,我的目标是用AVX2 intrinsics来加速这一点。以下代码适用于最新的Intel或GCC,基于https://blog.fox-toolkit.org/?p=174。我删除了这里的剩余部分,因为我的行都在4个双列(列%4==0)上对齐(幸运的我)。如果有人感兴趣的话,我也有处理余数的代码,但重点是,代码实际上稍微慢一点。我检查了反汇编,对于上面的版本,只有FP指令被生成,对于我的AVX2代码,所有的AVX2操作出现在预期中。即使有适合缓存的小矩阵,AVX2版本也不是很好。我很困惑。。。
double* value_base = &values[0];
double* x_base = &x[0];
int* index_base = &col_indices[0];
for (int row = 0; row < n_rows - 1; row++) {
int col_length = row_ptr[row + 1] - row_ptr[row];
__m256d rowsum = _mm256_set1_pd(0.);
for (int col4 = 0; col4 < col_length; col4 += 4) {
// Load indices for x vector(const __m128i*)
__m128i idxreg = _mm_load_si128((const __m128i*)index_base);
// Load 4 doubles from x indexed by idxreg (AVX2)
__m256d x_ = _mm256_i32gather_pd(x_base, idxreg, 8);
// Load 4 doubles linear from memory (value array)
__m256d v_ = _mm256_load_pd(value_base);
// FMA: rowsum += x_ * v_
rowsum = _mm256_fmadd_pd(x_, v_, rowsum);
index_base += 4;
value_base += 4;
}
__m256d s = _mm256_hadd_pd(rowsum, rowsum);
result[row] = ((double*)&s)[0] + ((double*)&s)[2];
// Alternative (not faster):
// Now we split the upper and lower AVX register, and do a number of horizontal adds
//__m256d hsum = _mm256_add_pd(rowsum, _mm256_permute2f128_pd(rowsum, rowsum, 0x1));
//_mm_store_sd(&result[row], _mm_hadd_pd( _mm256_castpd256_pd128(hsum), _mm256_castpd256_pd128(hsum) ) );
}
欢迎提出任何建议。
多谢,克里斯
在哈斯韦尔集合很慢。我用几种不同的方法实现了一个16位值的8位索引LUT查找(GF16乘以par2),以找出最快的方法。在Haswell上,
正如第一次引入指令时所常见的那样,他们不会投入大量的硅来使其超速。它只是为了得到硬件支持,所以可以编写代码来使用它。为了在所有CPU上实现理想的性能,您需要做x264为
对于那些不太热衷于为每一个CPU调整asm版本的项目来说,引入一个无加速比的指令版本会让人们更快地使用它,这样当下一个设计出现时,更快,更多的代码会加速。发布像Haswell这样的设计,而gather实际上是一种放慢速度的做法是有点冒险的。也许他们想看看人们会如何使用它?它确实增加了代码密度,当收集不是在一个紧密的循环中时,这会有所帮助。
Broadwell应该有一个更快的gather实现,但是我没有访问的权限。Intel手册列出了延时/吞吐量的说明,它说Broadwell's gather的速度大约是1.6倍,因此它仍然比手工构建的循环要慢一些,后者将GP regs中的索引移位/解包,并将它们用于
如果
希望Skylake能进一步改善。我以为我读到什么东西说它会,但一查,我什么也没发现。
RE:稀疏矩阵:难道不存在一种重复数据的格式,所以你可以对行或列进行连续读取吗?这不是我必须为之编写代码的东西,但我想我已经在一些答案中看到提到过它。