提问者:小点点

dplyr总结:相当于“. drop=FALSE”以保持输出中长度为零的组


当使用plyrddple函数时,默认情况下会删除空类别。您可以通过添加. drop=FALSE来更改此行为。但是,在使用dplyr摘要时,这不起作用。有没有其他方法可以在结果中保留空类别?

这是一个假数据的例子。

library(dplyr)

df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6))

# Now add an extra level to df$b that has no corresponding value in df$a
df$b = factor(df$b, levels=1:3)

# Summarise with plyr, keeping categories with a count of zero
plyr::ddply(df, "b", summarise, count_a=length(a), .drop=FALSE)

  b    count_a
1 1    6
2 2    6
3 3    0

# Now try it with dplyr
df %.%
  group_by(b) %.%
  summarise(count_a=length(a), .drop=FALSE)

  b     count_a .drop
1 1     6       FALSE
2 2     6       FALSE

不完全是我所希望的。是否有dplyr方法可以在plyr中实现与. drop=FALSE相同的结果?


共3个答案

匿名用户

这个问题仍然悬而未决,但与此同时,特别是因为您的数据已经被分解,您可以使用“tidyr”中的完成来获取您可能正在寻找的内容:

library(tidyr)
df %>%
  group_by(b) %>%
  summarise(count_a=length(a)) %>%
  complete(b)
# Source: local data frame [3 x 2]
# 
#        b count_a
#   (fctr)   (int)
# 1      1       6
# 2      2       6
# 3      3      NA

如果您希望替换值为零,则需要使用填充指定:

df %>%
  group_by(b) %>%
  summarise(count_a=length(a)) %>%
  complete(b, fill = list(count_a = 0))
# Source: local data frame [3 x 2]
# 
#        b count_a
#   (fctr)   (dbl)
# 1      1       6
# 2      2       6
# 3      3       0

匿名用户

由于dplyr 0.8group_by获得了. drop参数,该参数符合您的要求:

df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6))
df$b = factor(df$b, levels=1:3)

df %>%
  group_by(b, .drop=FALSE) %>%
  summarise(count_a=length(a))

#> # A tibble: 3 x 2
#>   b     count_a
#>   <fct>   <int>
#> 1 1           6
#> 2 2           6
#> 3 3           0

@Moody_Mudskipper的回答还有一个额外的注意事项:当一个或多个分组变量没有被编码为因子时,使用. drop=FALSE可能会给出意想不到的结果。请参阅下面的示例:

library(dplyr)
data(iris)

# Add an additional level to Species
iris$Species = factor(iris$Species, levels=c(levels(iris$Species), "empty_level"))

# Species is a factor and empty groups are included in the output
iris %>% group_by(Species, .drop=FALSE) %>% tally

#>   Species         n
#> 1 setosa         50
#> 2 versicolor     50
#> 3 virginica      50
#> 4 empty_level     0

# Add character column
iris$group2 = c(rep(c("A","B"), 50), rep(c("B","C"), each=25))

# Empty groups involving combinations of Species and group2 are not included in output
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally

#>   Species     group2     n
#> 1 setosa      A         25
#> 2 setosa      B         25
#> 3 versicolor  A         25
#> 4 versicolor  B         25
#> 5 virginica   B         25
#> 6 virginica   C         25
#> 7 empty_level <NA>       0

# Turn group2 into a factor
iris$group2 = factor(iris$group2)

# Now all possible combinations of Species and group2 are included in the output, 
#  whether present in the data or not
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally

#>    Species     group2     n
#>  1 setosa      A         25
#>  2 setosa      B         25
#>  3 setosa      C          0
#>  4 versicolor  A         25
#>  5 versicolor  B         25
#>  6 versicolor  C          0
#>  7 virginica   A          0
#>  8 virginica   B         25
#>  9 virginica   C         25
#> 10 empty_level A          0
#> 11 empty_level B          0
#> 12 empty_level C          0

Created on 2019-03-13 by the reprex package (v0.2.1)

匿名用户

首先使分组df

by_b <- tbl_df(df) %>% group_by(b)

然后我们通过使用n()计数来总结那些发生的级别

res <- by_b %>% summarise( count_a = n() )

然后我们将结果合并到包含所有因子级别的数据框中:

expanded_res <- left_join(expand.grid(b = levels(df$b)),res)

最后,在这种情况下,由于我们正在查看计数,因此NA值更改为0。

final_counts <- expanded_res[is.na(expanded_res)] <- 0

这也可以在功能上实现,参见答案:使用dplyr向分组数据添加行?

我想我会发布一个可怕的黑客,在这种情况下为了兴趣的缘故。我严重怀疑你应该真的这样做,但它显示了group_by()是如何生成属性的,就好像df$b是一个字符向量,而不是一个有级别的因素。此外,我不假装正确理解这一点——但我希望这有助于我学习——这是我发布它的唯一原因!

by_b <- tbl_df(df) %>% group_by(b)

定义数据集中不存在的“越界”值。

oob_val <- nrow(by_b)+1

将属性修改为“技巧”总结()

attr(by_b, "indices")[[3]] <- rep(NA,oob_val)
attr(by_b, "group_sizes")[3] <- 0
attr(by_b, "labels")[3,] <- 3

做总结:

res <- by_b %>% summarise(count_a = n())

索引和替换所有发生的oob_val

res[res == oob_val] <- 0

它给出了预期的:

> res
Source: local data frame [3 x 2]

b count_a
1 1       6
2 2       6
3 3       0