这可能被认为是对各种方法的彻底解释的重复,然而,由于数据帧的数量较多,我似乎无法找到解决问题的方法。
我有多个数据帧(超过10个),每个数据帧在一列varx
中不同。 这只是一个快速而过于简化的例子:
import pandas as pd
df1 = pd.DataFrame({'depth': [0.500000, 0.600000, 1.300000],
'VAR1': [38.196202, 38.198002, 38.200001],
'profile': ['profile_1', 'profile_1','profile_1']})
df2 = pd.DataFrame({'depth': [0.600000, 1.100000, 1.200000],
'VAR2': [0.20440, 0.20442, 0.20446],
'profile': ['profile_1', 'profile_1','profile_1']})
df3 = pd.DataFrame({'depth': [1.200000, 1.300000, 1.400000],
'VAR3': [15.1880, 15.1820, 15.1820],
'profile': ['profile_1', 'profile_1','profile_1']})
每个df
对于相同的轮廓具有相同或不同的深度,因此
我需要创建一个新的数据框架,它将合并所有单独的数据框架,其中操作的键列是depth
和profile
,每个配置文件的所有显示深度值。
因此,varx
值应该是nan
,因为对于该配置文件没有该变量的深度测量。
结果应该是一个新的压缩数据帧,其中所有varx
作为depth
和profile
列的附加列,如下所示:
name_profile depth VAR1 VAR2 VAR3
profile_1 0.500000 38.196202 NaN NaN
profile_1 0.600000 38.198002 0.20440 NaN
profile_1 1.100000 NaN 0.20442 NaN
profile_1 1.200000 NaN 0.20446 15.1880
profile_1 1.300000 38.200001 NaN 15.1820
profile_1 1.400000 NaN NaN 15.1820
请注意,配置文件的实际数量要大得多。
有什么想法吗?
考虑在每个数据帧上设置索引,然后使用pd.concat
运行水平合并:
dfs = [df.set_index(['profile', 'depth']) for df in [df1, df2, df3]]
print(pd.concat(dfs, axis=1).reset_index())
# profile depth VAR1 VAR2 VAR3
# 0 profile_1 0.5 38.198002 NaN NaN
# 1 profile_1 0.6 38.198002 0.20440 NaN
# 2 profile_1 1.1 NaN 0.20442 NaN
# 3 profile_1 1.2 NaN 0.20446 15.188
# 4 profile_1 1.3 38.200001 NaN 15.182
# 5 profile_1 1.4 NaN NaN 15.182
一种简单的方法是结合使用函数。partial
/reduce
。
首先,partial
允许“冻结”函数参数和/或关键字的某些部分,从而生成具有简化签名的新对象。 然后,使用reduce
,我们可以将新的部分对象累积应用到iterable的项(此处是数据帧列表):
from functools import partial, reduce
dfs = [df1, df2, df3]
merge = partial(pd.merge, on=['depth', 'profile'], how='outer')
reduce(merge, dfs)
depth VAR1 profile VAR2 VAR3
0 0.6 38.198002 profile_1 0.20440 NaN
1 0.6 38.198002 profile_1 0.20440 NaN
2 1.3 38.200001 profile_1 NaN 15.182
3 1.1 NaN profile_1 0.20442 NaN
4 1.2 NaN profile_1 0.20446 15.188
5 1.4 NaN profile_1 NaN 15.182
我会使用append。
>>> df1.append(df2).append(df3).sort_values('depth')
VAR1 VAR2 VAR3 depth profile
0 38.196202 NaN NaN 0.5 profile_1
1 38.198002 NaN NaN 0.6 profile_1
0 NaN 0.20440 NaN 0.6 profile_1
1 NaN 0.20442 NaN 1.1 profile_1
2 NaN 0.20446 NaN 1.2 profile_1
0 NaN NaN 15.188 1.2 profile_1
2 38.200001 NaN NaN 1.3 profile_1
1 NaN NaN 15.182 1.3 profile_1
2 NaN NaN 15.182 1.4 profile_1
显然,如果您有很多数据帧,只需列出一个列表并循环遍历它们。