我试图在RStudio(Windows 10)中运行Seurat管道,这需要安装python库“umap learn”(Seurat演练:https://satijalab.org/seurat/v3.0/pbmc3k_tutorial.html).
要安装上述库,我将以以下方式使用R中的网状库:
library(reticulate)
py_install(packages = 'umap-learn')
我得到以下错误:
Error in conda_python(envname = envname, conda = conda) :
conda environment r-reticulate not found
我已经尝试了我能想到的一切:
我对此束手无策——我的同事都没有这个问题。任何帮助都将不胜感激。
我也遇到了同样的问题,问题似乎是您需要首先手动创建r-networkite
环境。我是在Anaconda Navigator中手动完成的,但您也可以在r中执行conda_create(“r-neticulate”)
,如本教程所述。
我遇到了完全相同的问题,在找到这篇有用的文章后,我通过安装OpenSSL解决了这个问题。希望它对你有用!